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水样滤膜的保存

作者:Suzanne kennedy 来源:美国MoBio实验室【字号:

最近收到很多咨询,关于为了方便日后提取DNA,如何保存从海湾油污染海域收集到的水样滤膜。本文将与大家分享MOBIO这方面的研究心得。下面是来自佐治亚州大学一位研究人员发来的邮件以及我们给出的回覆。

问题:

这周末我们将前往墨西哥湾和佛罗里达群岛收集水样用于微生物分析。因此想了解,如何保存过已过滤水样的滤膜,方便后续使用你们的PowerWater Kit提取DNA。在野外,我们只能对水样先过滤,再把滤膜带回实验室进行下一步提取操作。由于野外条件有限,是否有不依赖冷冻的保鲜方法?是否兼容后续提取?这是我们最后一次采样,希望能尽量用好收集到的材料。

谢谢!

Heather Callahan 博士回覆

您好!根据去年以来我做的DNA、RNA相关实验,给出下面的建议。

这些建议经过修改可以用于保存Sterivex unit或者我们的平底过滤膜。

酒精在这种场合起不了作用。经验证明,无论用70%或者100%酒精,结果只能使得核酸大量丢失甚至完全降解。

清亮水样

干净水样的滤膜可以干燥后室温或-20℃冷冻保存在研磨管中(或sterivex unit中)。

冷冻干燥条件下滤膜上的DNA和RNA通常都很稳定。使用平的过滤滤膜时,这么处理是最省事的。因为,回到实验室后可直接加入裂解缓冲液进行后续处理,无需转移滤膜。对于使用Sterivex的,可用PowerWater® Sterivex™ DNA Isolation Kit,无需剪开过滤器取滤膜。

浑浊或者受污染水样

浑浊或受污染水样过滤滤膜也可以干燥保存在PowerWater的研磨管中。4℃保存条件下的样品,得到的DNA完整性比室温保存的更好。为了获得高质量DNA,短期室温最多只保存3天,若干燥冷冻可长期保存。

我们也测试了LifeGuard Soil Preservation Solution对滤膜DNA、RNA的保护。对于浑浊样品,能有效减少核酸降解。加入2-4ml LifeGuard到装有已过滤水样滤膜的研磨管中,浸润滤膜为度。4℃或更低温度长期保存(>一周)。

处理使用LifeGurad保存水样滤膜前,先离心。尽可能吸掉保护液,避免其过分稀释裂解缓冲液。另,为了使保护液尽可能去除,也可以把滤膜与研磨珠分开保存。

含大量金属离子水样

有些取自酸性矿洞或者地下洞穴的样品,腐植酸含量不高,却有可能含有大量金属离子。从PowerWater DNA Isolation Kit使用者反馈的信息可了解到,试剂盒所采用的IRT技术足可以完全去除金属离子并获得高质量PCR等级的DNA。

最后

每个项目具体情况各异,如果你对手上的样品了解不多,可联系我们。我们会根据多年经验给出合适建议。你可以采取不同办法,看怎么操作更适合你的样品。

关于如何选择过滤膜,请关注下一篇更新的文章。

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